С 1982г. на базе 3-й городской клинической больницы функционирует областной специализированный центр по оказанию помощи больным с заболеваниями печени, желчных путей и поджелудочной железы (60 коек) и городской гнойно-септический центр (60 коек). Центры являются базами Запорожского института усовершенствования врачей, где проходят подготовку врачи-интерны, клинические ординаторы, аспиранты и повышают квалификацию врачи-хирурги Украины (более 300 в год). Кафедра хирургии основана в 1955 году и на тот час являлась первой в городе. На сегодня кафедра обладает высоким научным потенциалом, имея в своём составе два доктора медицинских наук (профессора) и три кандидата медицинских наук. Сотрудники кафедры являются членами ассоциации хирургов-гепатологов Украины, а заведующий кафедрой является членом ассоциации хирургов-гепатологов стран СНГ и России.
Результаты научных достижений по внедрению аппаратных способов операций многократно представлялись на украинских и международных съездах и симпозиумах. Впервые Украина принимала участие во всемирной медицинской выставке “Медико-95“ (Голландия), где главную экспозицию представляли разработанные кафедрой инструменты и сшивающие аппараты.
За период работы клиники сформировался коллектив высококвалифицированных специалистов, которые прошли спецподготовку в отечественных и зарубежных клиниках. Центры располагают современной лечебно-диагностической аппаратурой позволяющей оказывать высококвалифицированную специализированную медицинскую помощь на уровне мировых стандартов больным с заболеваниями печени, желчевыводящих путей, поджелудочной железы, что привело к созданию в 2000г. центра малоинвазивной и эндоскопической билиарной хирургии. Широко внедрены в практику разнообразные малоинвазивные и высокотехнологичные операции: лапароскопические, эндоскопические (ретроградная холецистохолангиография, ретроградная панкреато(вирсунго)графия, эндоскопическая папиллосфинктеротомия, эндоскопическая супрапалиллярная холедоходуоденостомия, эндоскопическая холедохолитоэкстракция, эндоскопическое назобилиарное дренирование, эндоскопическая цистодуоденостомия, эндоскопическая установка стендов при стенотическом поражении желчных протоков и поджелудочной железы, эндоскопический забор содержимого гепатопанкреатической системы на цитологическое исследование), пункционно-дренирующие операции под контролем ультразвука (ультразвуковая днагностика полостных и объёмных образований органов брюшной полости, ультразвуковая диагностика осложнённых форм желчнокаменной болезни, чрезкожная чрезпечёночная холецистохолангиография, тонкоигольная аспирационная биопсия объёмных образований органов брюшной полости и забрюшинного пространства, трепанбиопсия объёмных образовании органов брюшной полости и забрюшинного пространства, пункция н дренирование полостных образований паренхиматозных органов, наложение холецисто-, гепатико-, холангиостом у больных с обтурацией протоков различного уровня и генеза, пункционные методы лечения хронического панкреатита). Операции на печени осуществляются с применением ультразвукового аспиратора, что позволяет избежать массивной кровопотери. На сегодняшний день клиника располагает наибольшим опытом в городе радикального хирургического лечения при заболеваниях поджелудочной железы, желчных путей, объёмных поражений печени.
Применение указанных способов оперативного лечения заболеваний печени, желчных путей и поджелудочной железы позволяет резко уменьшить продолжительность и травматичность операции, избежать осложнений, присущих старым способам хирургических вмешательств, а также сокращают пребывание больного в стационаре и материальные затраты на лечение.
Городской гнойно-септический центр осуществляет лечение больных с гнойными заболеваниями мягких тканей и сепсисом ургентно, круглосуточно. На базе центра развёрнуты палаты интенсивной терапии с индивидуальным постом. Благодаря экспресс-методу определения чувствительности микрофлоры к антибактериальным препаратам целенаправленная антибактериальная терапия осуществляется уже через 4 часа. Широко используются методы экстракорпоральной детоксикации. Разработаны и внедрены в практику методические рекомендации по лечению больных сепсисом.
В лечебном процессе клиники основное внимание приобрели доступность, качество и удовлетворительный результат хирургического лечения.